Responsive Image

 

 

Responsive Image

Metabolomika

Aurkezpena

Metabolomika plataforma Biobizkaia Institutuaren ikerketa babesteko plataforma bat da.

Metabolomikak organismo baten metabolitoen multzoa (bitarteko metabolikoak, hormonak, pisu molekular txikiko molekulak) une jakin batean lortzea ahalbidetzen duten hainbat analisi-teknika biltzen ditu. Kontrol-taldearen eta testamentu-taldearen arteko metabolomak konparatuz gero, aldeak aurki daitezke profiletan, baldintza biologiko jakin bati lotu dakizkiokeenak, eta baldintza horrekin zer metabolito lotzen diren eta gaixotasun baten diagnostikoaren edo eboluzioaren biomarkatzaile gisa jardun dezaketen zehaztu dezakete.

Biobizkaiko metabolomika-unitateak beharrezko ekipamendua, laguntza teknikoa eta prestakuntza espezializatua ditu gaixotasun metabolikoetan zehaztutako markatzaileak zehazteko, bai eta biomarkatzaile berriak bilatzeko ere, bai diagnostikokoak, bai pronostikokoak, bestelako patologiak eta nahasmenduak hobeto ulertzeko.

Deskribapen orokorra

Metabolomikak aplikazio erabakigarria du honako eremu hauetan:

  • Diagnostiko-biomarkatzaileen bilaketa eta gaixotasun-kasuetako bilakaera.
  • Entzima edo proteina jakin bat aldatzeagatik edo ez egoteagatik sortzen diren perturbazio metabolikoen azterketa.
  • Mantenugaien azken norakoa eta metabolismoan duten eragina aztertzea.
  • Azterlan toxikologikoak eta farmazeutikoak, baita azterketa lipidomikoetarako abiapuntua ere.

Metabolomikaren kasuan, tresna informatiko indartsuak eskuratu behar dira, bai analisi estatistikoa egin ahal izateko (laster-marken bilaketa), bai datu-base eta espektroteken bidez identifikatu ahal izateko.

Zerbitzuak

Zerbitzuen zorroa

Aplikazioak

Kreatinaren/guanidinoazetatoaren/kreatininaren analisia plasman eta gernuan.

  • Metodologia: Tandemeko masen espektrometria (MS/MS).
  • Funtzioa: Garunaren eta muskuluen funtzionamendu egokirako funtsezkoa den ibilbide metaboliko honek gaixotasun jakin batzuekin erlazionatzeko aukera emango du, gaixotasun horiek eragiten dituzten kausak, horien jarraipena nola egin eta tratamendurik egokiena nola egin aztertuz, batez ere giltzurrun-gutxiegitasuna, alterazio dietetikoak eta neurologikoak bezalako prozesuak.
  • Interes biomedikoa: neurologia, endokrinologia, nefrologia eta metabolismoko ikerketetarako interesa izan dezake.

Gernu-glukosaminoglikano totalak kuantifikatzea.

  • Metodologia: UV-Vis espectrofotometria.
  • Funtzioa: gaixotasun lisosomal batzuk detektatzea, zehazki mukopolisakaridosi mota batzuenak (Hurler, Hunter, Maroteaux-Lamy, Sanfilipo, Hurler-Schie). Mukopolisakaridosia lisosoman gertatzen den glukosaminoglikanoen metabolismoan esku hartzen duten entzimetako batean gaizki funtzionatzea da. Glukosaminoglikanoen degradazio eragozlearen ondorioz, glukosaminoglikanoak asko iraizten dira gernuan, eta hori diagnostikorako erabiltzen da.
  • Interes biomedikoa: Gaixotasun lisosomal horiek mota askotako fenotipoak dituzte, beste gaixotasun batzuk dituztenen antzekoak izan daitezkeenak. Azterketa zelularretarako ere erabiltzen dira.

Gantz-azidoak zehaztu plasman.

  • Metodologia: Sugarraren ionizazioko gasesa-detekzioko kromatografia.
  • Funtzioa: gantz-azidoen profilaren balorazioa, aldatuta egon baitaiteke eskasia-egoeren edo gaixotasunen ondorioz. Gantz-azidoak ere hanturarekin lotuta daude, beraz, gaixotasunean duten inplikazio patogenoarekin.
  • Interes biomedikoa: Interesa du nutrizioan, heldutasun-garapenean, hantura-prozesuetan eta gaixotasun neurodegeneratiboetan.
    Omega-3 gantz-azidoen eta, zehazkiago, azido dokosahexaenoikoaren (DHA) ekarpenaren garrantzia egiaztatu du, patologia kardiobaskularrak prebenitzeko eta haurraren garapen kognitibo egokirako. Helduen kasuan, metabolito horren ekarpena Alzheimerraren prebentzioarekin lotuta dago.

Azilkarnitinen profila zehaztea odol lehorrean.

  • Metodologia: Tandemeko masen espektrometria (MS/MS), ERNDIM bidez gainbegiratua.
  • Funtzioa: karnitina gantz-azidoen beta-oxidazioaren bitarteko metabolismoaren hainbat molekularekin elkartzen da, eta profil bereizgarri bat sortzen du, entzima baten funtzionamendu okerraren ondorioz metabolito jakin baten metaketa gertatzen denean aldatzen dena. Une horretan, metabolitoak karnitinarekin erreakzionatzen du eta, beraz, ateratzen den azilkarnitina odoleko kontzentrazio altuetan egongo da. Azilkarnitinen profila zehaztea tresna garrantzitsua da jaioberrien baheketarako, eta metabolismoaren sortzetiko errore batzuen diagnostiko goiztiarra egiteko aukera ematen du (akatsak gantz-azidoen beta-oxidazioan, azidema organikoak).
  • Interes biomedikoa: Jaioberrien baheketarako tresnarik garrantzitsuena da. Era berean, beta-oxidazioaren metabolismoaren akatsen teknika diagnostikoa da. Azilkarnitinen profila ere aldatuta dago nutrizio-gabezien kasuetan, eta berriki diabetesaren alterazioa eta minbizi mota batzuk deskribatu dira.

Dimetilarginina asimetrikoa (ADMA).

  • Metodologia: Tandemeko masen espektrometria bidez kuantifikatzea (MS/MS).
  • Funtzioa: Dimetilarginina asimetrikoa (ADMA) organismoko zelula guztietan sortzen da eta Arg-rekin lehiatzen da oxido nitriko sintasaren (NOS) isoformekin. Metatzeak estres oxidatiboa eta disfuntzio endoteliala eragiten ditu hainbat patologiatan.
  • Interes biomedikoa: endokrinologia, kardiologia, nefrologia, etab.

Metilazioaren zikloa (SAM/SAH).

  • Metodologia: UV-Vis espektrofotometriari akoplatutako likidoen kromatografia, nahiz eta teknika hori tandemeko masen espektrometrora akoplatzea aurreikusita dagoen.
  • Funtzioa: Metilazioaren zikloak erreakzio biokimiko batzuk ditu, eta horien bidez sortzen da homozistina (Hcys) markatzaile kardiobaskular gisa, eta horren aitzindariak dira S-adenosilmetionina (SAM) eta S-adenosilhomozistina (SAH). Ziklo honen bidez, ADN, RNA, neurotransmisoreak, proteinak, hormonak eta beste metabolito batzuk metilatzeko beharrezkoak diren metilo aktiboak sortzen dira, haien funtzionamendu normala ziurtatzeko helburuarekin.
  • Interes biomedikoa: biomedikoa: onkologia, neurologia, kardiologia, nefrologia, psikiatria, neuropediatria, etab.

Aminoazidoak zehaztea paperean dagoen odol lehorrean.

  • Metolodogía: Tandemeko masen espektrometria (MS/MS).
  • Funtzioa: aminoazidoen profil aldatua aminoazidoen bitarteko metabolismoaren hainbat nahasmenduk eragin dezakete. Giltzurrunetako gaixotasunetan, malnutrizio-egoeretan eta zenbait patologiatan ere alterazioak egon daitezke.
  • Interes biomedikoa: Aminoazidoen profilak gizabanakoaren nutrizio-egoerari buruzko informazioa ematen du, eta hainbat arlotarako erabiltzen den teknika da, hala nola metabolismoaren sortzetiko eroreak, onkologia, endokrinologia, neurologia eta abar.

Odol lehorreko entzima lisosomalen jarduera entzimatikoa zehaztea.

  • Metodologia: Une honetan Hunter, Maroteaux-Lamy, Gaucher eta Fabryren gaixotasuna eragiten duten entzimen fluorimetria bidezko entzima-jarduera detektatzen da.
  • Funtzioa: glicosaminoglizanoen metabolismo lisosomalean (GAG) esku hartzen duten entzimetako bat edo batzuk ez egoteak mukopolisakaridosia (MPS) eragiten du. Entzima horien ezaugarri nagusia da entzima horiek metatu egiten direla gorputzeko hainbat organo eta ehunetan, eta metabolito horiek patologikoki kanporatzen direla gernuan.
  • Interes biomedikoa: gaixotasun lisosomalen diagnostikoa. Gaixotasun batzuk diagnostikatzen zailak dira, eta beste sintoma mota batzuekin sendatzen dira; batzuetan, erreumatismo-kontsultetara edo kontsulta oftalmologikoetara bidaltzen dira.

Nitisinona (NTBC) odol lehorrean eta plasman kuantifikatzea.

  • Metodologia: Tandemeko masen espektrometriari akoplatutako kromatografia likidoa (MS/MS).
  • Funtzioa: I motako tirosinemia metabolismoaren berezko errorea da fumaril-azetoazetato hidrolasaren defizitaren ondorioz, azken entzima tirosina aminoazidoaren degradazio-bidean. Akats horren ondorioz, tirosina pilatzen da plasman, eta bide metaboliko sekundarioa aktibatzen da. Bide horrek suzcinilazetona eta succinilazetoazetona ekoizten ditu, eta horrek gibeleko eta giltzurrunetako toxikotasuna eragiten du.
    Tirosinemiaren lehen lerroko tratamendua proteina-murrizketa bat da, eta dietak ematen duen fenilalanina eta tirosina minimizatzen saiatzen da. Tratamendurik eraginkorrena 4-hidroxifenilpiruvato dioxigenasa entzima inhibitzea da, metabolito toxiko suzcinilazetona eta succinilazetoazetona sortzeko ardura duena, nitisinona farmakoaren bidez (NTBC).
  • Interes biomedikoa: I motako tirosinemia edo alkaptonuria duten pazienteak dituzten metabologo, endokrinologo, nefrologo eta hepatologoentzat interesgarria izan daiteke. Farmakoa monitorizatzea garrantzitsua da dosi optimoa paziente bakoitzari doitzeko; izan ere, handia izan daiteke droga metabolizatzeko arazo baten ondorioz, edo kontzentrazio murriztua izan dezake itsaspen baxuaren ondorioz, eta ez da nahikoa metabolito toxikoak sortzea saihesteko. Biobizkaiko OIIk 2015etik aztertzen du botika hori Espainiako eta Portugalgo mediku eta pazienteentzat.

Fenilazetilglutamina / Hipurikoa gernuan.

  • Metodologia: Tandemeko masen espektrometriari (MS/MS) akoplatutako kromatografia likidoa, isotopikoki markatutako konposatuak barne-patroi gisa erabiliz.
  • Funtzioa: Fenilbutiratoa (gatz sodikoa edo glizerol-esterra) eta benzoato sodikoa Urearen Zikloko akatsetan hiperamonemia tratatzeko erabiltzen diren botikak dira. Behin irentsita, fenilbutiratoa (PBA) azkar bihurtzen da fenilazetato (PAA), amonio-soberakinetik datorren glutaminarekin bat egiten duena, eta, aldi berean, gernuan iraizten den fenilazetilglutamina (PAGln) bihurtzen da. Era berean, Benzoato sodikoa (BA) amonio soberakinetik datorren glizinarekin elkartzen da eta iraitzi egiten den Hipurato (HA) bihurtzen da.
  • Interes biomedikoa: Ureako Zikloko paziente afektatuak dituzten metabologo, endokrinologo, neonatologo eta internistentzat interesgarria izan daiteke. Farmakoaren monitorizazioa garrantzitsua da dosi optimoa paziente bakoitzera doitzeko, eta kontzentrazio murriztua izan dezake eta amonio gehiegi kendu eta kendu ahal izateko nahikoa ez izan daiteke. Bi tratamenduekiko atxikidura egiaztatzeko, gernu-laginetan PAGln eta HA kuantifikatzen dira (ahal dela, goizeko lehena). Biobizkaiko OIIk 2018tik aztertzen du farmako hori Espainiako mediku eta pazienteentzat.

Azpiegiturak

Gaur egun, zerbitzuak azpiegitura hau dauka:

Gases kromatografoa sugarraren ionizazioaren detekzioarekin (FID) [GC Agilent 7890]

Gaur egun, plasmako gantz-azidoak eta zelula-hazkuntzak zehazteko erabiltzen da. Oro har, ekipoa konposatu organiko hegazkorrak aztertzeko prestatuta dago.

Bereizmen handiko kromatografo likidoa/kuadrupolo hirukoitzeko masa-detektagailua [Agilent 1100 - Agilent 6410 QQQ]

Pisu molekular txikiko molekulak hautematen ditu, sentikortasun eta selektibitate handiz. Gaur egun, odol lehorreko azilkarnitinen eta aminoazidoen profila zehazteko, hainbat markatzaile kardiobaskular zehazten dira, hala nola dimetilarginina asimetrikoa (ADMA) eta erlazionatutako molekulak, kreatina-guanidinoazetato-kreatinina ibilbidearen balorazioa, tirosinemia duten pazienteen NTBC farmakoaren kuantifikazioa.

UV-Vis espektrofotometroa [HP 8453]

Ekipoa talde kromoforoak dituzten konposatuak aztertzeko erabiltzen da, eta horien xurgapena UV-Vis tartearen barruan kokatzen da. Glukosaminoglizanoak zehazteko erabiltzen da, mukopolisakaridosia duten pazienteetan.

Plataformako kideak

Tarifak

Hauek dira plataformaren tarifak.

Aurrekontua/zerbitzua eskatzeko formularioa - Metabolomika

Responsive Image

Gurutzeta enparantza S/N | 48903 Barakaldo
Tel.: 94 618 26 22

© 2024 IIS Biobizkaia