Metabolomika proteomikoa
Metabolomika proteomikoa
Aurkezpena
Metabolomika eta Proteomika plataforma Biobizkaia Institutuaren ikerketarako laguntza plataformen parte da.
Unitatearen helburua metabolismoaren berezko akatsetan definitutako markatzaileak zehaztea eta biomarkatzaile berriak bilatzeko beharrezkoak diren ekipamendua, laguntza teknikoa eta prestakuntza espezializatua ematea da, bai diagnostikorako. eta pronostikoa, patologia metabolikoak eta bestelako nahasteak hobeto ezagutzeko aukera ematen dutenak.
Metabolomikak organismo baten metabolitoen multzoa (bitarteko metabolikoak, hormonak, pisu molekular baxuko molekulak) une jakin batean lortzea ahalbidetzen duten hainbat analisi-teknika biltzen ditu. Kontrol-taldearen eta probatutako taldearen arteko metabolomak alderatuz gero, haien profiletan desberdintasunak ager daitezke, zeinak egoera biologiko jakin batekin lotu daitezkeen, egoera horrekin zein metabolito lotzen diren eta zeintzuk diagnostiko edo eboluzio gisa joka dezaketen zehaztu ahal izateko. egoeraren biomarkatzailea bera, gaixotasun bat ikertzen bada.
Deskribapen orokorra
Analisi metabolomikoak funtsezko eginkizuna du arlo hauetan:
- Gaixotasunen diagnostikoa eta progresioa biomarkatzaileak bilatzea.
- Gene bat aldatu edo ezabatu ondoren zein aldaketa metaboliko ikusten diren identifikatzea.
- Elikagaien azken helmuga aztertzea eta horrek metabolismoan nola eragiten duen egiaztatzea.
- Toxikologia eta ikerketa farmazeutikoa.
Proteomika, batetik, organismo baten proteina multzoa aztertzean eta ezaugarritzean datza, eta, bestetik, gaixotasun jakin batzuei lotutako proteina-biomarkatzaileak bilatzea. Hau da, proteoma aztertuz, baldintza zehatzetan adierazten diren proteina multzoaren zerrenda lor dezakegu. Gainera, proteoma estres mota ezberdinetan (ingurumenekoa edo patologikoa) alderatuz gero, baldintza horietan zein proteina adierazten diren neurri handiagoan edo txikiagoan identifikatu dezakegu, eta zein proteina izan daitezkeen biomarkatzaile gisa gaixotasun bat diagnostikatzeko edo haren progresioa iragartzeko. .
Metabolomika zein Proteomika tresna bioinformatiko indartsuetan oinarritzen dira, biomarkatzaileak bilatzeko azterketa estatistikoa egiteko, eta, ondoren, datu-baseetan eta masa espektral liburutegietan markatzaileak identifikatzeko.
Zerbitzuak
Zerbitzuen zorroa
- Glucosaminoglycans - Espektrofotometria/OR. 2020ko ziurtagiria - 2019ko ziurtagiria - 2018ko ziurtagiria - 2017ko ziurtagiria - 2016ko ziurtagiria - 2015ko ziurtagiria - 2014ko ziurtagiria -
- Konplexu HCII-T (MPS I, II y VI) - ELISA/SR, SP.
- Heparan sulfatoa - ELISA/PL,SR.
- Gantz-azidoen profila (guztira eta zatikiak) - GC-FID/PL, HEM, TEJIDO.
- Azilkarnitina profila - HPLC-MS/MS/SP. 2020ko ziurtagiria - 2019ko ziurtagiria - 2018ko ziurtagiria - 2017ko ziurtagiria - 2016ko ziurtagiria - 2015ko ziurtagiria - 2014ko ziurtagiria -
- Karnitina librea/guztira - Espektrofotometria/PL, OR.
- Azido organikoen eta azilglizinen profila - GC-MS/OR. 2020ko ziurtagiria - 2019ko ziurtagiria - 2018ko ziurtagiria - 2017ko ziurtagiria - 2016ko ziurtagiria - 2015ko ziurtagiria - 2014ko ziurtagiria -
- Azido metilmalonikoa - GC-MS/OR.
- Azido glutarikoa eta 3-OH glutarikoa - GC-MS/OR.
- 3-OH azido propionikoa eta metilzitrikoa - GC-MS/OR.
- Aminoazidoen profila - Ioi-kromatografia/PL, OR, CSF.
- Arginina eta dimetilargininak (ADMA,SDMA, NMMA) - HPLC-MS/MS/PL, EDO.
- BH4 (Phe eta Tyr) gainkarga-proba - HPLC-UV/PL.
- Kreatina/guanidinoacetato - HPLC-MS/MS/PL, EDO.
- Kreatinina - HPLC-MS/MS / PL, EDO.
- Nitisinona (NTBC) HPLC-MS/MS / PL, SP. 2020ko ziurtagiria - 2019ko ziurtagiria -
- S-adenosilmetionina (SAM) eta S-adenosilhomocysteine (SAH).
- Glukosaminoglikanoen idazketa (GAG).
- Jaioberrien baheketa (azilkarnitina).
- Oinarrizko gaixotasunen baheketa metabolikoak (aminoazidoak/azido organikoak/azilkarnitinak).
- Fenilazetilglutamina / Hipurikoa (gernua).
- Fenilazetilglutamina / Hipurikoa (plasma).
- MPS I (alfa-iduronidasa) / SP jarduera entzimatikoa.
- MPS II (iduronato-2-sulfatasa) / SP jarduera entzimatikoa.
- MPS VI (arilsulfatasa B) / SP jarduera entzimatikoa.
- Fbry (alfa-galaktosidasa A) / SP jarduera entzimatikoa.
- Gaucher (beta-glukosidasa) / SP jarduera entzimatikoa.
Azpiegiturak
Gaur egun, zerbitzuak azpiegitura hauek ditu:
Gas-kromatografoa suaren ionizazioaren detekzioarekin (FID) [Agilent 7890 GC]
Gaur egun plasmako eta globulu gorrietako gantz-azidoak zehazteko erabiltzen da, baita frakzio lipido desberdinetan ere (fosfolipidoak, triglizeridoak eta kolesterol-esterrak). Oro har, ekipoak konposatu organiko lurrunkorrak aztertzeko prestatuta daude.
Errendimendu handiko kromatografo likido-masa-detektagailu hirukoitza [Agilent 1100 serie-Agilent 6410 QQQ]
2000 Da-tik beherako pisu molekularra duten molekula txikiak detektatzen ditu sentikortasun eta selektibitate handiarekin. Molekulek ez dute zertan lurrunkorrak izan. Gaur egun, odol lehorreko azilkarnitinen eta aminoazidoen profila zehazteko erabiltzen da, hainbat marka kardiobaskularren zehazteko, hala nola dimetilarginina asimetrikoa (ADMA) eta erlazionatutako molekulak, kreatina-guanidinoacetato-kreatinina bidearen ebaluazioa, NTBC sendagaiaren kuantifikazioa tirosinemia duten pazienteetan eta metilazio potentzialaren balorazioa plasmako S-adenosilmetionina eta S-adenosylhomocysteine analisiaren bidez.
Gas-kromatografo-masa espektrometroa [Agilent GC 5990-Agilent MSD 6410]
Lurrunkorrak diren edo derivatizazioaren bidez lurrunkor bihurtzen diren mota guztietako molekula txikietarako erabilgarria. Gaur egun, gernu-azido organikoen profila aztertzeko, azido metimalonikoaren eta succinilazetona detektatzeko erabiltzen da.
Kromatografo ioiko aminoazidoen analizatzailea [Biochrom 30]
Plasma, gernu eta likido zerebroespinaleko aminoazidoak aztertzera soilik zuzendutako ekipamendua.
UV-Vis espektrofotometroa [HP 8453]
Ekipoa kromoforo-taldeak dituzten eta UV-Vis barrutian duten xurgapena duten konposatuak aztertzeko erabiltzen da. Mukopolisakaridosia duten pazienteetan glukosaminoglikanoak determinatzeko eta plasmako karnitina libre eta esterifikatuaren determinazio entzimatikorako erabiltzen da.
Plakako fluorometroa
Haren akatsak hainbat gaixotasun lisosomal mota eragiten dituen entzima batzuen jarduera kuantifikatzeko erabiltzen da. Zerbitzuaren ekipamenduaren erabilera Gurutzetako Unibertsitate Ospitaleko ikertzaile guztientzat zabalik dago, baita beste ikerketa-zentro batzuentzat ere, publiko zein pribatuentzat.
Plataformako kideak
-
Fernando Andrade Lodeiro
fernando.andradelodeiro@bio-bizkaia.eus
Metabolómica proteómica
846327
Edificio Biocruces Bizkaia 2 | Cruces, Bizkaia