Responsive Image

 

 

Responsive Image

Metabolomika proteomikoa

Aurkezpena

Metabolomika eta Proteomika plataforma Biobizkaia Institutuaren ikerketarako laguntza plataformen parte da.

Unitatearen helburua metabolismoaren berezko akatsetan definitutako markatzaileak zehaztea eta biomarkatzaile berriak bilatzeko beharrezkoak diren ekipamendua, laguntza teknikoa eta prestakuntza espezializatua ematea da, bai diagnostikorako. eta pronostikoa, patologia metabolikoak eta bestelako nahasteak hobeto ezagutzeko aukera ematen dutenak.

Metabolomikak organismo baten metabolitoen multzoa (bitarteko metabolikoak, hormonak, pisu molekular baxuko molekulak) une jakin batean lortzea ahalbidetzen duten hainbat analisi-teknika biltzen ditu. Kontrol-taldearen eta probatutako taldearen arteko metabolomak alderatuz gero, haien profiletan desberdintasunak ager daitezke, zeinak egoera biologiko jakin batekin lotu daitezkeen, egoera horrekin zein metabolito lotzen diren eta zeintzuk diagnostiko edo eboluzio gisa joka dezaketen zehaztu ahal izateko. egoeraren biomarkatzailea bera, gaixotasun bat ikertzen bada.

Deskribapen orokorra

Analisi metabolomikoak funtsezko eginkizuna du arlo hauetan:

  • Gaixotasunen diagnostikoa eta progresioa biomarkatzaileak bilatzea.
  • Gene bat aldatu edo ezabatu ondoren zein aldaketa metaboliko ikusten diren identifikatzea.
  • Elikagaien azken helmuga aztertzea eta horrek metabolismoan nola eragiten duen egiaztatzea.
  • Toxikologia eta ikerketa farmazeutikoa.

Proteomika, batetik, organismo baten proteina multzoa aztertzean eta ezaugarritzean datza, eta, bestetik, gaixotasun jakin batzuei lotutako proteina-biomarkatzaileak bilatzea. Hau da, proteoma aztertuz, baldintza zehatzetan adierazten diren proteina multzoaren zerrenda lor dezakegu. Gainera, proteoma estres mota ezberdinetan (ingurumenekoa edo patologikoa) alderatuz gero, baldintza horietan zein proteina adierazten diren neurri handiagoan edo txikiagoan identifikatu dezakegu, eta zein proteina izan daitezkeen biomarkatzaile gisa gaixotasun bat diagnostikatzeko edo haren progresioa iragartzeko. .

Metabolomika zein Proteomika tresna bioinformatiko indartsuetan oinarritzen dira, biomarkatzaileak bilatzeko azterketa estatistikoa egiteko, eta, ondoren, datu-baseetan eta masa espektral liburutegietan markatzaileak identifikatzeko.

Zerbitzuak

Zerbitzuen zorroa

Aplikazioak

Kreatina/guanidinoazetato/kreatinina plasman eta gernuan aztertzea.

  • Metodologia: Tandem masa-espektrometria (MS/MS), ERNDIMek gainbegiratua.
  • Funtzioa: Garunaren eta giharrak behar bezala funtzionatzeko ezinbestekoa den ibilbide metaboliko honek gaixotasun jakin batzuekin erlazionatzea ahalbidetuko du, eragiten dituzten arrazoiak, haien jarraipena nola egin eta tratamendu egokiena aztertuz. , batez ere giltzurrun-gutxiegitasuna, alterazio dietetikoak eta neurologikoak bezalako prozesuak.
  • Interes biomedikoa: neurologoentzat, endokrinologoentzat, nefrologoentzat eta metabologoentzat balizko interesgarria da.

Glukosaminoglikano osoaren kuantifikazioa gernuan.

  • Metodologia: UV-Vis espektrofotometria, ERNDIMek gainbegiratua.
  • Funtzioa: gaixotasun lisosomiko batzuen detekzioa, zehazki, hainbat mukopolisakaridosi mota (Hurler, Hunter, Maroteaux-Lamy, Sanfilipo, Hurler-Schie).
    Mukopolisakaridosak lisosoman gertatzen den glukosaminoglikanoen (heteropolisakaridoak) metabolismoan parte hartzen duten entzimetako baten matxura batean datza. Glukosaminoglikanoen degradazio oztopatuak gernuan iraizketa handia eragiten du, diagnostikorako erabiltzen dena.
  • Interes biomedikoa: gaixotasun lisosomiko hauek fenotipo oso anitzak aurkezteagatik bereizten dira, beste gaixotasun batzuek dituztenen antzekoak izan daitezkeenak. Ondorioz, beharrezkoa da gaixotasunaren detekzio goiztiarra metodologia sinpleen bidez.
    Eremu honen barruan, gure taldeak bulegoan mukopolisakaridosia azkar detektatzeko kit bat (GAG-test®) garatu berri du.

Plasma, globulu gorri eta ehunetako gantz-azidoak zehaztea.

  • Metodologia: gas-kromatografia-sugar ionizazioaren detekzioa.
  • Funtzioa: gantz-azidoen profilaren ebaluazioa, gabezia-egoeren edo gaixotasunen ondorioz alda daitekeelako. Gantz-azidoak hanturarekin ere lotuta daude, beraz, gaixotasunaren parte-hartze patogenoarekin.
  • Interes biomedikoa: elikaduran, heltze-garapenean, hantura-prozesuetan eta gaixotasun neurodegeneratiboetan interesa du.
    Frogatuta dago omega-3 gantz-azidoak eta, zehatzago, azido dokosahexaenoikoa (DHA) ematearen garrantzia, patologia kardiobaskularrak prebenitzeko eta haurraren garapen kognitibo zuzenerako. Helduen kasuan, metabolito horren ekarpena Alzheimerraren prebentzioarekin lotuta dago.
    Bestalde, Metabolismo Unitatea, Haurren Alergia, Pneumologia eta Gastroenterologia Zerbitzuekin elkarlanean, gantz-azidoen profilaren eta elikagaien alergien, Fibrosi Kistikoaren eta Exofagitisaren arteko erlazioa bilatzen duten hainbat ikerketa egiten ari da.

Plasmako karnitina osoa eta librea kuantifikatzea.

  • Metodologia: UV-Vis espektrofotometria, ERNDIMek gainbegiratua.
  • Funtzioa: karnitina gantz-azidoak mitokondriara garraiatzeko lotzen diren molekula da, non beta-oxidazioa egiten baita energia lortzeko. Beta-oxidazioaren akats entzimatikoek edo karnitinari loturiko gantz-azidoak mintzetan zehar garraiatzen dituzten entzimetan, karnitina-kontzentrazioa aldatu egiten da.
  • Interes biomedikoa: Teknika honetan interesa litezkeen Zerbitzuak Endokrinologia, Metabolismoa, Kardiologia eta Lokomozio Aparatua dira, izan ere, metabolito honek garatzen dituen funtzioen alterazioak hutsegiteak eragin ditzake, batez ere funtzioetan. mintza.gibela, bihotza eta hezur-muskulu-zelulak.

Azilkarnitina-profila zehaztea odol lehorrean.

  • Metodologia: Tandem masa-espektrometria (MS/MS), ERNDIMek gainbegiratua.
  • Funtzioa: Karnitina aminoazidoen bitarteko metabolismoaren eta gantz-azidoen beta-oxidazioaren hainbat molekularekin lotzen da, profil ezaugarri bat sortzen du, eta hori gertatzen denean aldatzen da. metabolito jakin bat, entzima baten funtzionamendu txarraren ondorioz. Une horretan, gehiegizko metabolitoak karnitinarekin erreakzionatzen du eta, hortaz, ondoriozko azilkarnitina kontzentrazio altuetan aurkituko da odolean.
    Azilkarnitina profila zehazteak tresna garrantzitsua da jaioberrien baheketa egiteko, eta metabolismoaren jaiotzetiko hainbat akatsen diagnostiko goiztiarra ahalbidetzen du (gantz-azidoen beta-oxidazioaren akatsak, azidemia organikoak).
  • Interes biomedikoa: jaioberrien baheketa egiteko tresnarik garrantzitsuena da. Era berean, beta-oxidazioaren metabolismoaren akats ezberdinen diagnostiko teknika da. Azilkarnitina profila ere aldatu egiten da nutrizio gabezien kasuetan, eta diabetean duen alterazioa deskribatu berri da.

Dimetilarginina asimetrikoa (Adma).

  • Metodologia: kuantifikazioa tandem masa-espektrometria erabiliz (MS/MS).
  • Funtzioa: dimetilarginina asimetrikoa (ADMA) gorputzeko zelula guztietan sortzen da eta Arg-ekin lehiatzen da oxido nitrikoaren (NOS) isoformetarako. Bere metaketak estres oxidatiboa eta disfuntzio endotelialak sortzen ditu patologia ugaritan.
  • Interes biomedikoa: Endokrinologia, Kardiologia, Nefrologia, etab.

Metilazio-zikloa (Sam/Sah).

  • Metodologia: UV-Vis espektrofotometriarekin akoplatutako kromatografia likidoa, nahiz eta teknika hau tandem masa espektrometroarekin lotzea aurreikusten den.
  • Funtzioa: metilazio-zikloa erreakzio biokimiko batzuen bidez osatzen da, zeinen bidez homozisteina (Hcys) markatzaile kardiobaskular gisa sortzen da eta bere aitzindariak S-adenosilmetionina (SAM) eta S-adenosilhomocysteine ​​( SAH). Ziklo honen bidez, DNA, RNA, neurotransmisoreak, proteinak, hormonak eta bestelako metabolitoak metilatzeko beharrezkoak diren metil talde aktiboak sortzen dira, haien funtzionamendu normala bermatzeko helburuarekin.
  • Interes biomedikoa: Onkologia, Neurologia, Kardiologia, Nefrologia, Psikiatria, Neuropediatria, etab.

Plasma eta gernuko aminoazidoak zehaztea.

  • Metodologia: ioi-kromatografia zutabearen osteko derivatizazioarekin eta detekzio fotometrikoarekin.
  • Funtzioa: aminoazidoen profila aldatuta tarteko aminoazidoen metabolismoaren hainbat nahasteengatik izan daiteke. Giltzurruneko gaixotasunetan, desnutrizio egoeretan eta zenbait gaixotasunetan ere aldaketak egon daitezke. Plasmako aminoazidoen kontzentrazioa kontrolatzea ezinbestekoa da gaixotasun metaboliko askotan.
  • Interes biomedikoa: aminoazidoen profilak gizabanakoaren nutrizio-egoeraren berri ematen du, baina metabolismoaren jaiotzetiko akats askoren diagnostiko-teknika da. Era berean, aminoazidoen profila aldatuta ikusi da beste gaixotasun batzuetan, hala nola minbizian eta Down sindromean.

Odol lehorrean entzima lisosomikoen jarduera entzimatikoaren zehaztapena.

  • Metodologia: Fluorimetria. Momentu honetan, Hunter, Maroteaux-Lamy, Gaucher eta Fabry gaixotasunaren ardura duten entzimen jarduera entzimatikoa detektatzen da.
  • Funtzioa: glukosaminoglikanoen metabolismo lisosomikoan (GAG) parte hartzen duten entzima bat edo gehiago ez egoteak mukopolisakaridosiak (MPS) sortzen ditu, hainbat organo eta gorputz-ehunetan metatzen direlako. eta metabolito horiek gernuan kanporatze patologiko baten bidez.
  • Interes biomedikoa: gaixotasun lisosomikoen diagnostikoa. Gaixotasun batzuk diagnostikatzeko zailak dira eta beste sintoma mota batzuk aurkezten dituzte, batzuetan erreuma edo oftalmologia kontsultetara bidaltzen dira.

Nitisinona (NTBC) kuantifikatzea odol eta plasma lehorrean.

  • Metodologia: kromatografia likidoa tandem masa-espektrometriarekin akoplatuta (MS/MS).
  • Funtzioa: I motako tirosinemia metabolismoaren berezko akatsa da, fumaril-acetoacetato hidrolasaren gabeziaren ondorioz, tirosina aminoazidoaren degradazio-bideko azken entzima. Akats horren ondorioz, tirosina plasman pilatzen da, eta gibeleko eta giltzurruneko toxikotasuna eragiten duten sucinilazetona eta succinilazetoazetona ekoizten dituen bigarren mailako bide metaboliko baten aktibazioa gertatzen da.
    Tirosinemiaren lehen lerroko tratamendua proteinak murriztean datza, dietak ematen duen fenilalanina eta tirosina edukia gutxitzen saiatzen dena. Tratamendu eraginkorrena 4-hidroxifenilpiruvato dioxigenasa entzimaren inhibizioan datza, sucinilazetona eta succinilazetoazetona metabolito toxikoen eraketaz arduratzen dena, nitisinona (NTBC) sendagaia erabiliz.
  • Interes biomedikoa: I. motako tirosinemia edo alkaptonuria duten gaixoen metabologo, endokrinologo, nefrologo eta hepatologoentzat balizko interesgarria da. Sendagaiaren monitorizazioa garrantzitsua da paziente bakoitzari dosi optimoa egokitzeko, izan ere, handia izan daiteke droga metabolizatzeko arazo baten ondorioz, edo kontzentrazioa gutxitu eta metabolito toxikoen sorrera ekiditeko nahikoa ez izatea.

Fenilazetilglutamina / Hipurikoaren kuantifikazioa gernuan.

  • Metodologia: kromatografia likidoa tandem masa-espektrometriarekin (MS/MS) akoplatuta, isotopikoki etiketatutako konposatuak barne estandar gisa erabiliz.
  • Funtzioa: fenilbutiratoa (sodio gatz moduan edo glizerola ester moduan) eta sodio benzoatoa Urea Zikloko akatsetan hiperamonemia tratatzeko erabiltzen diren sendagaiak dira. Behin irentsita, Phenylbutyrate (PBA) azkar eraldatzen da Phenylacetate (PAA) glutaminari lotzen zaio gehiegizko amoniotik, eta, aldi berean, Phenylacetylglutamine (PAGln) bihurtzen da gernuan kanporatzen dena. Modu berean, sodio benzoatoa (BA) gehiegizko amoniakotik datorren glizinarekin konjokatu eta kanporatzen den hipurato (HA) bihurtzen da.
  • Interes biomedikoa: Metabolologo, endokrinologo, neonatologo eta internistentzat balizko interesgarria izan daiteke Urea Zikloak eragindako pazienteekin. Droga kontrolatzea garrantzitsua da paziente bakoitzari dosi optimoa egokitzeko, eta baliteke kontzentrazio txikia izatea eta gehiegizko amonioa kelatu eta kentzeko nahikoa ez izatea. Bi tratamenduen atxikimendua egiaztatzeko, PAGln eta HA kuantifikatzen dira gernu-laginetan (ahal bada, goizean lehen orduan).

Azpiegiturak

Gaur egun, zerbitzuak azpiegitura hauek ditu:

Gas-kromatografoa suaren ionizazioaren detekzioarekin (FID) [Agilent 7890 GC]

Gaur egun plasmako eta globulu gorrietako gantz-azidoak zehazteko erabiltzen da, baita frakzio lipido desberdinetan ere (fosfolipidoak, triglizeridoak eta kolesterol-esterrak). Oro har, ekipoak konposatu organiko lurrunkorrak aztertzeko prestatuta daude.

Errendimendu handiko kromatografo likido-masa-detektagailu hirukoitza [Agilent 1100 serie-Agilent 6410 QQQ]

2000 Da-tik beherako pisu molekularra duten molekula txikiak detektatzen ditu sentikortasun eta selektibitate handiarekin. Molekulek ez dute zertan lurrunkorrak izan. Gaur egun, odol lehorreko azilkarnitinen eta aminoazidoen profila zehazteko erabiltzen da, hainbat marka kardiobaskularren zehazteko, hala nola dimetilarginina asimetrikoa (ADMA) eta erlazionatutako molekulak, kreatina-guanidinoacetato-kreatinina bidearen ebaluazioa, NTBC sendagaiaren kuantifikazioa tirosinemia duten pazienteetan eta metilazio potentzialaren balorazioa plasmako S-adenosilmetionina eta S-adenosylhomocysteine ​​​​analisiaren bidez.

Gas-kromatografo-masa espektrometroa [Agilent GC 5990-Agilent MSD 6410]

Lurrunkorrak diren edo derivatizazioaren bidez lurrunkor bihurtzen diren mota guztietako molekula txikietarako erabilgarria. Gaur egun, gernu-azido organikoen profila aztertzeko, azido metimalonikoaren eta succinilazetona detektatzeko erabiltzen da.

Kromatografo ioiko aminoazidoen analizatzailea [Biochrom 30]

Plasma, gernu eta likido zerebroespinaleko aminoazidoak aztertzera soilik zuzendutako ekipamendua.

UV-Vis espektrofotometroa [HP 8453]

Ekipoa kromoforo-taldeak dituzten eta UV-Vis barrutian duten xurgapena duten konposatuak aztertzeko erabiltzen da. Mukopolisakaridosia duten pazienteetan glukosaminoglikanoak determinatzeko eta plasmako karnitina libre eta esterifikatuaren determinazio entzimatikorako erabiltzen da.

Plakako fluorometroa

Haren akatsak hainbat gaixotasun lisosomal mota eragiten dituen entzima batzuen jarduera kuantifikatzeko erabiltzen da. Zerbitzuaren ekipamenduaren erabilera Gurutzetako Unibertsitate Ospitaleko ikertzaile guztientzat zabalik dago, baita beste ikerketa-zentro batzuentzat ere, publiko zein pribatuentzat.

Plataformako kideak

Tarifak

Hauek dira plataformaren kuotak.

Harremanetarako formularioa

Aurrekontua/zerbitzua eskatzeko formularioa - Metabolomika

Responsive Image

Gurutzeta enparantza S/N | 48903 Barakaldo
Tel.: 94 618 26 22

© 2024 IIS Biobizkaia